牛粪的主要用途有建沼气池、生产有机肥、生产双孢菇、养蚯蚓、作燃料等。牛粪是牛的排泄物，在一些养牛比较集中的地方，基本上都没有牛粪处理设施。这样导致牛粪到处乱堆乱放，尤其在南方，每到夏季，臭气冲天。既对周边居民的正常生活造成不良影响，同时牛粪又是多种细菌病原体孳生繁殖的源头。

牛粪处理很重要，通过建沼气池处理牛粪，效果十分理想，它既解决了群众的燃料来源，又使牛粪得到了充分腐熟。干牛粪经过发酵可以成为优质的有机肥产品，能蓬松土壤，改善土地板结情况，提升土壤肥力等。

牛粪的用途很多，以前直接发酵后做农作物的基肥，可以变粪为宝，加工成有机肥，从而获取较高的效益。利用牛粪加工有机肥，首先要把牛粪晾晒或沥干，使其水分控制在85%以下，然后加入秸秆末，牛粪和秸秆末的比例为7:3，使原料（牛粪）、辅料（秸秆末）的碳比控制在23～28，含水量控制在52%～68%。最后再加入有机肥发酵腐熟剂。

用牛粪做原料生产有机肥，成本小，质量比较稳定，市场销售空间很大。但传统堆沤的方法，不仅发酵速度慢，而且还不能让牛粪彻底腐熟，施入农田后易发生“二次发酵”，造成烧根烧苗的现象。