在道教神系中，玉皇大帝与西王母没有任何关系，但在一些民间故事，小说中说两人是夫妻关系。实际上王母娘娘出现的时间比玉皇大帝早，王母娘娘在天上的地位很高。

王母娘娘是仙女之首，很多人认为王母娘娘的原型是《穆天子传》中的西王母。从古代神仙的发展历程来看，西王母的出现远远早于玉皇大帝。在春秋战国时期西王母就出现了，而此时与其并列的是东王公。由此可知，王母娘娘要比玉皇大帝出现早得多，更别提成为他的妻子。

后来随着仙道历史的不断发展，成为天界最高统治者的玉皇大帝还是孤家寡人，于是西王母摇身一变就成了人们配给玉皇大帝的皇后。在一些神道小说和影视作品中玉皇大帝和王母娘娘成为了一对恩爰的夫妻，还经常要像寻常百姓家的父母一样为孩子们感情的事情操心。