太湖水质污染的根本原因：1、化工、纺织印染、黑色冶金等污染行业产生的工业污染流入太湖。2、太湖流域地区随着工业化、城市化进程的加快，区域内人口剧增，产生的生活污水量较之以前迅速增大。3、太湖水域捕鱼的船只众多，现在的捕鱼船多是用柴油作为动力，燃烧不充分，产生的气态颗粒污染物随风飘落到太湖中，污染水体。

太湖流域是长江水系最下游的一个支流区域，以太湖为中心，西界天目山、茅山，东、北、南三边面江临海，面积36500平方千米，以黄浦江为主要泄水道，形成一个相对封闭的独立的水资源区。

太湖来水量的大小与水质好坏，直接影响黄浦江的水质。由于沿太湖的城镇将污水排入河道、流入太湖、太湖部分水域也受到轻、中度污染。

太湖污染源以沿湖城镇和入湖河流带进来的污染物为主，由于太湖容积大，清洁水补给来源多，以致目前太湖仍能保持比较好的水质。但近年来，太湖西部水域营养过剩，出现营养型污染，已经引起广泛注意。