起源不同：水果玉米起源于前哥伦比亚时期的中美洲和南美洲。中国是普通糯玉米的世界起源中心，栽培历史悠久。分类不同：水果玉米从含糖量上分为普通型水果玉米、超甜型水果玉米、加强甜水果玉米。颜色有黄色、白色、双色、和纯白色四种。普通玉米照颜色可以分为白色糯玉米、黄色糯玉米、黑色糯玉米、彩色糯玉米。

特点不同：水果玉米植株较矮，分蘖力较强；果穗苞叶上有旗叶。子粒淡黄或白色，胚较大，乳熟期子实柔嫩、富含水溶性多糖、维生素A、维生素C等。普通玉米栽培技术简单、周期短，具有较高的经济价值、营养价值和加工价值，深受玉米产业者的欢迎。

水果玉米是适合生吃的一种超甜玉米，与一般玉米相比，它的主要特点是青棒阶段皮薄、汁多、质脆而甜，可直接生吃，薄薄的表皮一咬就破，清香的汁液溢满齿颊，生吃熟吃都特别甜、特别脆，像水果一样。

水果玉米富含维生素A、B1、B2、C、E胡萝卜素和亚油酸、矿物质及游离氨基酸等，是一种新兴休闲食品。水果玉米比普通玉米颗粒更饱满、鲜嫩，色搜索泽为金黄色。从口感上看，水果玉米和普通玉米相比它具有甜、糯、嫩、香的特点。