显微镜是由主机架、物镜、目镜、镜筒、载物台五大部分组成。显微镜以显微原理进行分类可分为偏光显微镜、光学显微镜与电子显微镜和数码显微镜。偏光显微镜是用于研究所谓透明与不透明各向异性材料的一种显微镜，在地质学等理工科专业中有重要应用。通常皆由光学部分、照明部分和机械部分组成。

主机架用于支持整台显微镜及维持平稳，是整个显微镜的主体。物镜是决定显微镜的分辨率和成像清晰程度的主要部件。目镜是用来观察前方光学系统所成图像的目视光学器件。镜筒是安装在镜臂上方的圆筒状结构，上连目镜，下连物镜转换器。载物台是镜筒下方的平台，中央有一圆形的通光孔，用于放置载玻片。显微镜是人类最伟大的发明物之一，它把一个全新的世界展现在人类的面前。

通常皆由光学部分、照明部分和机械部分组成。无疑光学部分是最为关键的，它由目镜和物镜组成。早于1590年，荷兰和意大利的眼镜制造者已经造出类似显微镜的放大仪器。光学显微镜的种类很多，主要有明视野显微镜（普通光学显微镜）、暗视野显微镜、荧光显微镜、相差显微镜、激光扫描共聚焦显微镜、偏光显微镜、微分干涉差显微镜、倒置显微镜。

显微镜目镜长度与放大倍数呈负相关，物镜长度与放大倍数呈正相关。即目镜长度越长，放大倍数越低；物镜长度越长，放大倍数越高。