1、名称不同：芥菜在南方不同地区有不同的叫法，如大头菜、大菜、芽菜等；而在北方地区，芥菜有时则被称为芥菜或野菜。2、做法不同：南方芥菜主要食用芥菜叶子，烹饪方法是腌制成酸菜，再用来炒肉或制作酸菜鱼。而北方芥菜主要食用芥菜的根部，其根部呈疙瘩状，腌制后可用来炒肉或做咸菜。

南方芥菜和北方芥菜的区别

芥菜是十字花科，芸苔属一年生草本植物，高可达150厘米，幼茎及叶具刺毛，有辣味。中国各地栽培。叶盐腌供食用；种子及全草供药用，能化痰平喘，消肿止痛；种子磨粉称芥末，为调味料；榨出的油称芥子油。欧美各国极少栽培，起源于亚洲，李时珍著《本草纲目》记载了医用芥菜的医用价值。

芥菜在中国各地栽培，标本采自亚洲，多分布于中国长江以南各省。除高寒和干旱地区外，在中国不存在分布边界，东至沿海各省，西抵新疆维吾尔自治区，南至海南省三亚市，北到黑龙江省漠河市，从长江中下游平原到青藏高原都有芥菜栽培。

芥菜最常见的吃法是腌制酸菜。去掉芥菜根部，取叶与梗的部分可以腌制成南方的酸菜，可以随时取用制作其他美食，像酸菜鱼、芥菜炒肉，取芥菜根部呈疙瘩状的部分，进行整体腌制，腌制完成后可以随时取用制作其他美食，如芥菜炒饭或单纯用调味拌成下饭咸菜。