盐析法沉淀蛋白质的原理是：由于向蛋白质溶液中加入了大量的盐，如硫酸铵、氯化钠等，因此使得蛋白质表面的电荷被中和，破坏了其表面的水化膜，于是达到蛋白质沉淀的效果。

蛋白质的基本单位是氨基酸，氨基酸脱水缩合后连成肽链，而蛋白质就是由一条或多条多肽链组成的生物大分子。其分子表面多为亲水基团，可吸引水分子使其表面形成一层水化膜，抑制颗粒的相互聚集，其表面还带有电荷，使颗粒间互斥不易聚成团，防止蛋白质沉淀析出。