线粒体的DNA位于线粒体的基质中。

DNA是脱氧核糖核酸的简称，携带着合成RNA和蛋白质所必需的遗传信息，是生物体发育和运作的必需生物大分子。线粒体由线粒体外膜、线粒体膜间隙、线粒体内膜、和线粒体基质四个功能区组成，是细胞中产生能量的结构，也是细胞进行有氧呼吸的主要场所，直径在0.5到1.0微米左右。可以说除了溶组织内阿米巴和蓝氏贾第鞭毛虫等几种微孢子虫，大多数的真核细胞都拥有线粒体。